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腹腔鏡器械的清洗是消毒和滅菌中的一個重要環節，通過清洗能去除器械90%以上的病原體。目前腹腔鏡器械的清洗主要采用人工清洗方法。
手術結束后，將腔鏡器械傳遞到供應室，清洗人員對器械進行檢查分類，沖洗除去表面污物，沖洗后將器械放在酶清潔劑浸泡10 min，因酶可迅速分解蛋白質和有機物，使殘留血液、有機物、粘液等不至于凝固而吸附在器械上，從而易于清洗。并將所有能拆卸的部件全部取下，分開放置，各套管芯拔出，充分浸泡。然后用流動水認真清洗每一部件，帶有管腔的器械應用柔軟的毛刷反復洗刷，以兩端見刷頭為準，徹底清除所有的組織碎片，同時去除其他有機物。再用超聲清洗機進行5-7min的超聲，在進行漂洗、漂洗結束后進行酸化水消毒，再次進行漂洗，清洗干凈后放在器械專用潤滑液里潤滑約2 min后取出，并將各關節各鉗葉打開，有管腔的器械用高壓氣槍向管腔吹入壓縮氣體直至無水分排出，使其充分干燥。
腹腔鏡清洗操作流程
第一步：將腔鏡完全浸泡在清洗液中，確保所有可觸及的表面都被濕潤。
第二步：用無絨紙或適當的清洗刷洗，直到清除可見表面上的所有污漬為止。
第三步：清洗過程中，向各個方向運非固定元件3次，應該運動到它能達到的最大范圍。每次沖洗時應該使用未用過的水。使用（20ml）一次性注射器沖洗所有看不到的表面至少5次，例如：隱藏的縫隙、管道（工作管道）或者復雜的結構。
第四步：將腔鏡完全浸泡在消毒液中，同第三步清洗流程再操作一遍。
第五步：消毒之后徹底沖洗腔鏡，同第三步清洗流程再操作一遍。
第六步：用無絨布擦干產品，可用醫用等級的過濾壓縮空氣（最大壓力=0.5bar）吹干無絨布不能進入的部位。
鏡頭的處理
手術結束后使用蘸有中性多酶清潔劑的濕紗布對鏡頭及各種導線表面血跡、污漬進行擦拭，使用紗布塊擦干，鏡面用棉球順時針方向進行擦拭，避免用粗糙布巾擦拭，以免損傷鏡面，影響術中使用。
腹腔鏡器械的保養
腹腔鏡器械精密，精細。清洗時分開放置，用軟毛刷刷洗后，用氣槍吹干，器械軸節部浸入潤滑劑中，整齊排列、放入籃筐中。管腔器械用氣槍吹干，尖細器械尖端套硅膠管保護，松緊適宜。生銹的器械采用專用除銹劑進行除銹處理，然后進行常規清洗，清洗后再作潤滑、干燥處理。這樣對器械起到保養、延長其使用壽命的作用。
腹腔鏡器械清洗時注意事項
清洗時要防止腔鏡器械各附件的缺失，由于腹腔鏡器械緊密復雜，很多器械都配有小的附件，因此在拆卸清洗時，刷洗槽內最好鋪有過濾網，以防沖入下水道丟失。
腹腔鏡器械的消毒及滅菌
當前普遍使用的方法是最安全最可靠的過氧化氫等離子低溫滅菌，與傳統的滅菌方法相比較具有滅菌效果確切、快速、安全、環保等優點，也有效地減少腹腔的損傷，通常由專人負責管理低溫滅菌器，將腹腔鏡器械用無紡布或者低溫包裝袋包裝包裝外注明腔鏡器械的名稱、滅菌時間及有效期。正常選擇的滅菌模式是加強模式，滅菌時間60min，每一鍋都有生物、物理、化學監測，非常嚴密，可達到理想的滅菌效果。
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